Lo fundó en 1518 Leonor Laso de la Vega y Figueroa, miembro de la noble familia pacense de los Figueroa, Duques de Feria, contando entre sus miembros con personajes tan destacados como Lorenzo Suárez de Figueroa, embajador de los Reyes Católicos en Italia y del que se conserva la lauda sepulcral en el claustro de la Catedral.
Entre las numerosas vicisitudes históricas vividas por el convento, cabe destacar la muerte en 1580 de la Reina Ana de Austria, mujer de Felipe II, el cual se encontraba en la ciudad con motivo de hacer valer sus derechos al trono de Portugal. La reina estuvo enterrada en el convento hasta su posterior traslado al Escorial. Carlos III le concedió el título de “Real”, colgándose sus armas en un escudo de mármol sobre la portada de la iglesia en 1771.
El templo contiene importantes obras de arte en tallas, pinturas y retablos de los siglos XVI, XVII y XVIII.