El edificio está fechado en el siglo XVII y fue mandando a construir, al igual que el Colegio de los Jesuitas, por el comerciante frexnense Alonso de Paz.                  

De la iglesia destacan tres retablos que fueron realizados gracias a la “manda pía” de Juan Bravo Murillo. Justo encima del coro se encuentra un lienzo del siglo XVII atribuido al artista Domingo de Urbín y que representa la aparición de la Virgen María a San Ildefonso de Toledo.     

La comunidad sigue conservando una vértebra cervical como reliquia de una de las Agustinas más renombradas, Sor Asunción Galán de San Cayetano, cuya rigurosa penitencia sorprendió a la comunidad religiosa y civil del momento. Las monjas en la actualidad elaboran dulces artesanos que venden en el propio convento.